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mRNA(messenger RNA)信使RNA,是由编码区(CDS)、上游的5’非编码区和下游3’非编码区组成,真核生物mRNA的5’端带有7-甲基鸟苷-三磷酸帽子结构,3’端有多腺苷酸尾巴,但NCBI中mRNA序列实际上是cDNA序列,即经过反转录得到的与RNA序列互补的DNA序列,一般不包括3’多腺苷酸尾巴。一个cDNA序列被称为一个转录子,第一个碱基所在的位置为转录起始位点(TSS),cDNA都是由外显子组成,但编码蛋白质的外显子只有一个,即CDS(coding sequence),这段序列也就是一个ORF区,也就是这个cDNA的ORF序列。参与特定基因转录及其调控的TSS上游序列称为启动子(Promoter),如原核生物在转录起始位点上游-10有一段TATAAT的保守序列,有助于局部解链,在-35有一段TTGACA序列提供RNA聚合酶识别信号,真核生物上游-25到-30TATA决定起始位点,-75位置CAAT与RNA聚合酶,这些都是启动子,启动子的范围非常大,可以包含转录起始位点上游2000bp,有些特定基因的转录区内部也存在着转录因子的结合位点,因此也属于启动子范围。
克隆可以简单理解为复制品,例如假设通过提取mRNA,反转录后得到cDNA序列,然后将这段序列转入载体,再通过划线不断的繁殖,就会得到许多装有这段cDNA序列的克隆,实验室为了方便,在给得到的这些克隆起名时,一般会取cDNA序列的名,但实际上在这个克隆里面不仅包括了这个cDNA,还包括了载体的DNA。
STS(sequence-tagged site)序列标记位点,是基因组上定位明确、作为界标并能通过PCR扩增被唯一操作的短的、单拷贝DNA序列,一般长度为200-500bp,一个DNA序列要成为STS,首先序列必须已知,能用PCR方法检测,第二STS必须在基因组上具有唯一的定位点。通过STS可以判断在不同条件下测序得到的DNA序列的准确性。
EST(expressed sequence tag)表达序列标签,是从一个随机选择的cDNA克隆,进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA序列。全基因组测序发现基因既昂贵又费时,因为基因组中只有2%序列编码蛋白质,因此可以对真正编码蛋白质的mRNA构建cDNA文库,对cDNA进行测序,得到EST序列,从而发现新基因。
下面以大鼠CTGF基因为例子,小写字母是转录子前后200bp启动子相关序列,大写字母表示的是cDNA序列,也就是转录子,其中蓝色标记的部分为CDS序列,湖蓝色的为转录起始位点,即TSS,加粗带下划线的为起始密码子
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国家航天局发布我国天问一号火星探测任务着陆和巡视探测系列实拍影像。火星上的声音!伟大的中国,奋进中的中国!
时隔六年,微软于2021年6月24日正式发布了 Windows 11 桌面操作系统,这是微软推出新的 Windows 系统,也是微软 Windows 系统十年来最重要升级。Windows 11 采用了全新设计的 UI,还带来了诸如原生运行安卓应用、新的微软商店以及性能和多任务的改进等重磅新功能。
看来数字更新太快,我们变老了!